Espero desliarte un poco.
A mi me ha pasado lo mismo en mis tres embarazos. Mis reglas son de entre 32 y 35 días. Los ginecólogos cuentan las semanas desde la última regla, por lo cual en tu caso deberías de estar de 6 semanas en la 1 eco como bien has dicho, pero al ser cada 32 días, en relidad estarías de 5 semanas. Entre la 5 y la 7 semana, la diferencia del embrión en la eco es mínima, por ello no se aprecia bien la diferencia, pero en la que te hicieron correspondiente a la semana 12, si se aprecia bien en que semana estas por el tamaño del embrión y el desarrollo de sus extremidades y órganos. Por lo que yo creo que quien menos se equivoca es quien te hizo la ecografía de las 12 semanas, con lo cual, lo más seguro es que tengas una semana y pico de retraso respecto a la ovulación, con lo cual estarías de 10 semanas y algún día, aunque ellos redondean casi siempre. Espero haberte ayudado, te lo he explicado lo mejor que he sabido, ya que así me lo explico a mi mi ginecólogo. De todas formas si no lo tienes clar, preguntale directamente al gine, supongo que no pondrá pega alguna en explicartelo.
Un saludo.